第1章　生命科学
　1-1　原核細胞と真核細胞
　　細胞の分類とウイルス

　1-2　細胞内小器官
　　細胞内小器官とその役割

　1-3　細胞周期
　　細胞分裂と細胞周期

　1-4　DNA の複製
　　ゲノムDNA の半保存的複製

　1-5　転写
　　ゲノムDNA からのさまざまなRNAの合成

　1-6　翻訳
　　タンパク質の生合成

　1-7　核酸の構造と機能
　　DNAとRNA の構造と機能

　1-8　アミノ酸の構造と性質
　　20種類の生体アミノ酸の構造と性質

　1-9　タンパク質の階層構造
　　タンパク質の役割と一次〜四次構造

　1-10　生体膜と膜タンパク質
　　生体膜の構造と膜タンパク質の機能

　1-11　翻訳後修飾
　　タンパク質の翻訳後修飾とその役割

　1-12　免疫と代謝
　　抗体による免疫・生体内物質の代謝パスウェイ

　1-13　シグナル伝達
　　細胞間のシグナル伝達によるコミュニケーション

　1-14　遺伝
　　メンデルの法則による遺伝子の世代間継承

　1-15　ゲノムと生物
　　生物ゲノムのサイズと遺伝子地図

　1-16　ヒトゲノム
　　ヒトゲノムの構造と遺伝的多型

　1-17　遺伝子組換え
　　主要な遺伝子組換え技術

　1-18　ゲノム解析
　　ショットガン法による全ゲノム解読とゲノムワイド解析技術

　1-19　分子生物学実験技術
　　分子生物学分野を飛躍的に発展させた実験技術

　1-20　タンパク質の立体構造決定
　　X線結晶解析法などによるタンパク質の立体構造の解析技術

第2章　計算科学
　2-1　2進数
　　2進数と論理演算

　2-2　論理回路
　　論理回路によるコンピュータ上の論理演算

　2-3　プログラミング言語
　　コンピュータのプログラミング言語と計算の実行

　2-4　マークアップ言語
　　XML などのマークアップ言語によるデータ記述

　2-5　プロトコル
　　ネットワークの通信プロトコルとセキュリティ

　2-6　データ構造
　　プログラム内の代表的なデータ構造

　2-7　二分探索
　　高速にデータを検索する二分探索アルゴリズム

　2-8　ソートアルゴリズム
　　高速にデータを並べ替えるソートアルゴリズム

　2-9　バブルソート
　　基本的なバブルソートのアルゴリズム

　2-10　オートマトン
　　オートマトンによる状態・遷移データの表現

　2-11　リレーショナルデータベース
　　リレーショナルデータベースによるデータの整理

　2-12　SQL
　　SQL によるリレーショナルデータベースの操作

　2-13　正規分布
　　正規分布の性質

　2-14　独立性
　　確率分布と独立性・ベイズ推定

　2-15　統計的検定
　　統計的検定による仮説の検証

　2-16　最尤推定
　　確率分布の最尤法による推定

　2-17　機械学習
　　機械学習とデータマイニング

　2-18　クラスタリング
　　 k平均法によるデータのクラスタリング

　2-19　機械学習の評価
　　感度・特異度による予測法の評価

　2-20　交差検証
　　クロスバリデーション（交差検証）による予測法の評価

第3章　配列解析
　3-1　分子生物学データベース
　　国際的な公共の分子生物学データベース

　3-2　配列アラインメント
　　動的計画法による配列アラインメントの計算

　3-3　スコア行列
　　アミノ酸の類似性スコアとその統計的評価

　3-4　高速な類似配列検索
　　高速に配列を比較するための計算技術

　3-5　ホモロジー検索
　　高速にホモロジー検索するためのプログラム

　3-6　マルチプルアラインメント
　　マルチプルアラインメントによる配列の多重比較

　3-7　モチーフ
　　保存された配列パターン（配列モチーフ）の解析

　3-8　ゲノムプロジェクトと遺伝子予測
　　ゲノム解読と遺伝子予測によるアノテーション

　3-9　タンパク質の機能予測
　　タンパク質の生理学的機能の予測

　3-10　RNA の二次構造予測
　　RNA のもつ二次構造とその予測法

　3-11　ゲノム特徴抽出
　　ゲノム配列の塩基組成などに基づく特徴抽出

　3-12　ゲノム比較
　　ゲノム配列の比較解析とオーソログ解析

第4章　構造解析
　4-1　構造化学
　　ペプチド結合の構造化学

　4-2　タンパク質の立体構造
　　タンパク質立体構造の形成と分子グラフィックス表現

　4-3　構造モチーフ
　　タンパク質立体構造中の超二次構造と構造モチーフ

　4-4　構造分類
　　タンパク質立体構造の分類

　4-5　その他の生体分子の立体構造
　　DNAとRNAの立体構造

　4-6　立体構造データベース
　　立体構造データベースPDBとPDB フォーマット

　4-7　立体構造の比較
　　立体構造を構造重ね合わせにより比較する方法

　4-8　タンパク質立体構造の保存性分析
　　構造重ね合わせによるタンパク質立体構造の保存性分析

　4-9　相互作用分析
　　タンパク質立体構造による相互作用分析

　4-10　マップ分析
　　タンパク質立体構造のマップ分析

　4-11　立体構造予測
　　タンパク質の立体構造を予測する方法

　4-12　分子動力学計算
　　分子動力学計算による分子運動のシミュレーション

第5章　遺伝・進化解析
　5-1　ハーディー・ワインベルク平衡
　　対立遺伝子頻度のハーディー・ワインベルク平衡

　5-2　連鎖解析
　　連鎖解析による遺伝子座の探索

　5-3　遺伝子マーカー
　　遺伝的多型と遺伝子マーカーとしての利用

　5-4　ゲノムワイド関連解析
　　ゲノムワイド関連解析（GWAS）による遺伝子の探索

　5-5　分子進化
　　分子進化の中立説と分子時計

　5-6　進化系統樹
　　進化系統樹の表現方法

　5-7　パラログ・オーソログ
　　進化系統樹によるホモログ・パラログ・オーソログの解析

　5-8　系統推定アルゴリズム
　　系統樹をつくるための系統推定アルゴリズム

第6章　オーミクス解析
　6-1　オーミクス解析の研究手法
　　オーミクス解析に用いる研究手法と実験機器

　6-2　次世代シークエンサ
　　従来型DNA シークエンサと次世代シークエンサ

　6-3　DNA マイクロアレイ
　　DNA マイクロアレイによる遺伝子発現・遺伝的多型などの大量解析

　6-4　タンパク質間相互作用
　　タンパク質間相互作用の大量解析手法

　6-5　遺伝子発現クラスタリング
　　遺伝子発現パターンによるサンプルのクラスタリング

　6-6　微分方程式
　　微分方程式による遺伝子発現量の変動予測

　6-7　システム安定性
　　固有値の分析によるシステムの安定性解析

　6-8　ネットワークの構造と性質
　　ネットワークの構造とダイナミクス

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　練習問題解答一覧
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