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目次
バイオインフォマティクス入門
B5判/並製/176頁
初版年月日:2015/08/31
ISBN:
978-4-7664-2251-1
 
(4-7664-2251-1)
Cコード:C3045
税込価格:2,916円
バイオインフォマティクス入門

目次

第1章 生命科学
 1-1 原核細胞と真核細胞
  細胞の分類とウイルス

 1-2 細胞内小器官
  細胞内小器官とその役割

 1-3 細胞周期
  細胞分裂と細胞周期

 1-4 DNA の複製
  ゲノムDNA の半保存的複製

 1-5 転写
  ゲノムDNA からのさまざまなRNAの合成

 1-6 翻訳
  タンパク質の生合成

 1-7 核酸の構造と機能
  DNAとRNA の構造と機能

 1-8 アミノ酸の構造と性質
  20種類の生体アミノ酸の構造と性質

 1-9 タンパク質の階層構造
  タンパク質の役割と一次〜四次構造

 1-10 生体膜と膜タンパク質
  生体膜の構造と膜タンパク質の機能

 1-11 翻訳後修飾
  タンパク質の翻訳後修飾とその役割

 1-12 免疫と代謝
  抗体による免疫・生体内物質の代謝パスウェイ

 1-13 シグナル伝達
  細胞間のシグナル伝達によるコミュニケーション

 1-14 遺伝
  メンデルの法則による遺伝子の世代間継承

 1-15 ゲノムと生物
  生物ゲノムのサイズと遺伝子地図

 1-16 ヒトゲノム
  ヒトゲノムの構造と遺伝的多型

 1-17 遺伝子組換え
  主要な遺伝子組換え技術

 1-18 ゲノム解析
  ショットガン法による全ゲノム解読とゲノムワイド解析技術

 1-19 分子生物学実験技術
  分子生物学分野を飛躍的に発展させた実験技術

 1-20 タンパク質の立体構造決定
  X線結晶解析法などによるタンパク質の立体構造の解析技術

第2章 計算科学
 2-1 2進数
  2進数と論理演算

 2-2 論理回路
  論理回路によるコンピュータ上の論理演算

 2-3 プログラミング言語
  コンピュータのプログラミング言語と計算の実行

 2-4 マークアップ言語
  XML などのマークアップ言語によるデータ記述

 2-5 プロトコル
  ネットワークの通信プロトコルとセキュリティ

 2-6 データ構造
  プログラム内の代表的なデータ構造

 2-7 二分探索
  高速にデータを検索する二分探索アルゴリズム

 2-8 ソートアルゴリズム
  高速にデータを並べ替えるソートアルゴリズム

 2-9 バブルソート
  基本的なバブルソートのアルゴリズム

 2-10 オートマトン
  オートマトンによる状態・遷移データの表現

 2-11 リレーショナルデータベース
  リレーショナルデータベースによるデータの整理

 2-12 SQL
  SQL によるリレーショナルデータベースの操作

 2-13 正規分布
  正規分布の性質

 2-14 独立性
  確率分布と独立性・ベイズ推定

 2-15 統計的検定
  統計的検定による仮説の検証

 2-16 最尤推定
  確率分布の最尤法による推定

 2-17 機械学習
  機械学習とデータマイニング

 2-18 クラスタリング
   k平均法によるデータのクラスタリング

 2-19 機械学習の評価
  感度・特異度による予測法の評価

 2-20 交差検証
  クロスバリデーション(交差検証)による予測法の評価

第3章 配列解析
 3-1 分子生物学データベース
  国際的な公共の分子生物学データベース

 3-2 配列アラインメント
  動的計画法による配列アラインメントの計算

 3-3 スコア行列
  アミノ酸の類似性スコアとその統計的評価

 3-4 高速な類似配列検索
  高速に配列を比較するための計算技術

 3-5 ホモロジー検索
  高速にホモロジー検索するためのプログラム

 3-6 マルチプルアラインメント
  マルチプルアラインメントによる配列の多重比較

 3-7 モチーフ
  保存された配列パターン(配列モチーフ)の解析

 3-8 ゲノムプロジェクトと遺伝子予測
  ゲノム解読と遺伝子予測によるアノテーション

 3-9 タンパク質の機能予測
  タンパク質の生理学的機能の予測

 3-10 RNA の二次構造予測
  RNA のもつ二次構造とその予測法

 3-11 ゲノム特徴抽出
  ゲノム配列の塩基組成などに基づく特徴抽出

 3-12 ゲノム比較
  ゲノム配列の比較解析とオーソログ解析

第4章 構造解析
 4-1 構造化学
  ペプチド結合の構造化学

 4-2 タンパク質の立体構造
  タンパク質立体構造の形成と分子グラフィックス表現

 4-3 構造モチーフ
  タンパク質立体構造中の超二次構造と構造モチーフ

 4-4 構造分類
  タンパク質立体構造の分類

 4-5 その他の生体分子の立体構造
  DNAとRNAの立体構造

 4-6 立体構造データベース
  立体構造データベースPDBとPDB フォーマット

 4-7 立体構造の比較
  立体構造を構造重ね合わせにより比較する方法

 4-8 タンパク質立体構造の保存性分析
  構造重ね合わせによるタンパク質立体構造の保存性分析

 4-9 相互作用分析
  タンパク質立体構造による相互作用分析

 4-10 マップ分析
  タンパク質立体構造のマップ分析

 4-11 立体構造予測
  タンパク質の立体構造を予測する方法

 4-12 分子動力学計算
  分子動力学計算による分子運動のシミュレーション

第5章 遺伝・進化解析
 5-1 ハーディー・ワインベルク平衡
  対立遺伝子頻度のハーディー・ワインベルク平衡

 5-2 連鎖解析
  連鎖解析による遺伝子座の探索

 5-3 遺伝子マーカー
  遺伝的多型と遺伝子マーカーとしての利用

 5-4 ゲノムワイド関連解析
  ゲノムワイド関連解析(GWAS)による遺伝子の探索

 5-5 分子進化
  分子進化の中立説と分子時計

 5-6 進化系統樹
  進化系統樹の表現方法

 5-7 パラログ・オーソログ
  進化系統樹によるホモログ・パラログ・オーソログの解析

 5-8 系統推定アルゴリズム
  系統樹をつくるための系統推定アルゴリズム

第6章 オーミクス解析
 6-1 オーミクス解析の研究手法
  オーミクス解析に用いる研究手法と実験機器

 6-2 次世代シークエンサ
  従来型DNA シークエンサと次世代シークエンサ

 6-3 DNA マイクロアレイ
  DNA マイクロアレイによる遺伝子発現・遺伝的多型などの大量解析

 6-4 タンパク質間相互作用
  タンパク質間相互作用の大量解析手法

 6-5 遺伝子発現クラスタリング
  遺伝子発現パターンによるサンプルのクラスタリング

 6-6 微分方程式
  微分方程式による遺伝子発現量の変動予測

 6-7 システム安定性
  固有値の分析によるシステムの安定性解析

 6-8 ネットワークの構造と性質
  ネットワークの構造とダイナミクス

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